《学科能力标准与教学指南：初中生物》主要包括三个部分：
　　第一部分，学科教学的指导意见。具体内容包括：（1）阐述初中生物学科的教育教学价值；（2）梳理初中生物学科课程改革取得的成效与经验；（3）发现初中生物学科教学中存在的主要问题；（4）提出进一步推进初中生物学科教学改革的建议。
　　第二部分，学科能力标准与教学指南。依据《义务教育生物学课程标准（2011年版）》，从促进学生学科能力发展的角度提出具体教学建议。具体内容包括：（1）生物学科能力标准整体描述；（2）生物学科能力标准与教学建议。
　　第三部分，教学案例及评析。依据《义务教育生物学课程标准（2011版）》的十个主题选择典型、适宜的教学案例，重在分析每个案例教学目标中的能力培养、教学过程中促进学生能力发展的具体活动和教学策略。《学科能力标准与教学指南：初中生物》共收纳了22个案例，均选自近年北京市各类专题公开课、研究课和教学评比，并由初中生物学科市、区教研员修改并进行点评。

第一部分 学科教学指导意见

第二部分 学科能力标准与教学指南

第三部分 教学案例及评析
主题一 科学探究
“解剖器的规范使用”教学案例及评析
“校园植物观察”教学案例及评析
主题二 生物体的结构层次
“细胞是生命活动的基本单位”教学案例及评析
“单细胞生物可以独立完成生命活动”教学案例及评析
主题三 生物与环境
“细菌和真菌在自然界中的作用”教学案例及评析
“生态系统的自我调节能力是有限的”教学案例及评析
主题四 生物圈中的绿色植物
“绿色植物对有机物的利用”教学案例及评析
“细胞的吸水与失水条件”教学案例及评析
主题五 生物圈中的人
“能量来自细胞中有机物的氧化分解”教学案例及评析
“视觉的形成、异常和保健”教学案例及评析
“反射的结构基础——反射弧”教学案例及评析
“尿液的形成——肾小球的滤过作用”教学案例及评析
主题六 动物的运动和行为
“运动的意义”教学案例及评析
“动物的运动”教学案例及评析
主题七 生物的生殖、发育与遗传
“鸟类的生长和发育”教学案例及评析
“生物性状的遗传”教学案例及评析
主题八 生物的多样性
“细菌、真菌与食品”教学案例及评析
“生命的起源”教学案例及评析
主题九 生物技术
“传统生物技术的应用”教学案例及评析
主题十 健康地生活
“传染病”教学案例及评析
“免疫”教学案例及评析
附录1 北京市初中科学类学科教学改进意见
附录2 生物学科利用社会资源，丰富学生实践活动的课程开发目录（部分）
附录3 生物学科利用社会资源，丰富学生实践活动的教学设计样例
后记