全书共六卷。卷一“玄元肤论”，论述《内经》十二官及阴阳、五行理论；卷二“主客辨疑”，论述中风及其后遗症与厥脱的鉴别，以及伤寒、温病、郁病的证治；卷三“绛雪丹书”，专论血证并附有以上病证方剂；卷四、卷五为“先天要论”，主要论述六味丸、八味丸的组成与应用，滋阴降火、相火龙雷、阴虚发热等理论，以及痰、咳、吐血等的证治；卷六为“后天要论”，主要论述补中益气汤及伤饮食、中暑、湿、疟、痢疾等的证治。