全书正文分为五篇，包括16个章节。第一篇遗产价值与申遗历程，分为3章，分别介绍了青田稻鱼共生系统特征与价值、世界上第一个正式授牌的全球重要农业文化遗产保护试点和青田稻鱼共生系统的现代启示；第二章遗产动态保护与传承，包含4章，系统讲解了种质资源保护与利用、面向生态功能提升的农耕技术、传统知识保护与传承和传统文化弘扬与发展；第三篇遗产利用与发展，包含3章，分析了稻鱼共生产业升级、功能拓展与产业延伸和品牌建设与市场推广；第四篇遗产保护的能力建设，包含3章，阐述了保护与管理制度建设、保护与传承人才培养和保护与发展科技支撑；第五篇保护示范与经验推广，讲解了媒体宣传语广泛传播，模式与技术推广和国内外交流与合作。