本套书是一部收集养成类冒险漫画, 故事里充满各种生动可爱的名叫“宝可梦”的生物。故事主线围绕着“宝可梦”系列游戏的剧情展开。第56册讲述的是年幼时曾经在宝可梦青少年大赛中获得冠军的艾克斯, 因不堪众望所赋的压力而将自己封闭在房间好几年。不管好友华依怎么劝说他离开房间, 但是都以失败而告终。而艾克斯的另外几位儿时玩伴提耶鲁诺、莎娜和多罗巴也在为艾克斯担心。这时, 记者三色堇和紫罗兰来到朝香镇想要采访华依, 但却被华依迁怒而匆匆结束了采访。这边, 多罗巴接到了布拉塔诺博士的立体投影邮件, 并从配送员那里收到了新的宝可梦伙伴, 他想用这些宝可梦再次唤醒艾克斯当宝可梦训练家的初心。但是突如其来的传说宝可梦哲尔尼亚斯和伊裴尔塔尔却摧毁了朝香镇, 让大家陷入了困境。