《本草纲目研究札记》是“本草纲目研究集成”丛书之一。《本草纲目研究札记》共五卷。第一卷“思路方法”，体现各子书编纂的设计思路、编纂方法及体例。第二卷“人书考订”，涉及《本草纲目》版本及《本草纲目研究札记》所引人物与书籍的考证。第三卷“字词释证”，探讨《本草纲目》中的文字正误、名词释义等问题。第四卷“药物及炮制辨析”，为《本草纲目》部分药物的基原考证、药用历史、炮制方法等研究。第五卷“足迹花絮”，反映本丛书编委在《本草纲目》译释交流、田园调研、文化探讨等方面的心得与感悟。以上各卷所收诸文多为“本草纲目研究集成”编委所撰。书末附孙启明遗著《苏图研究》，系苏颂《本草图经》药物基原专论。

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目录
总序
总前言
前言
第一卷 思路方法
试论《本草纲目》编纂中的几个问题 003
《本草纲目研究集成》的总体设计随想 028
《本草纲目导读》散谈 033
《本草纲目》整理研究的再思考 038
《本草纲目》金陵本的常见讹误及订误心得 046
《本草纲目》图例校勘与考证 053
《本草纲目引文溯源》研究发微 078
关于《本草纲目辞典》方剂辞条撰写备忘 085
《本草纲目续编》编纂散谈 094
《本草纲目药物古今图鉴》药与图之互鉴思考 100
关于核准《本草纲目》引用医药书目的意义与方法讨论 105
《本草纲目》引文溯源文献计量与分析 113
第二卷 人书考订
古代《本草纲目》主要版本承继表 137
《本草纲目》金陵本研究概况及若干问题再思考 138
中国中医科学院图书馆藏《本草纲目》金陵本考察纪要 148
从“水松”看《本草纲目》早期版本传承 153
《本草纲目》现金陵版重修本 158
国内新现《本草纲目》两种金陵版考察 161
两种《本草纲目》金陵本在河南发现 165
东瀛访书记 168
江西本在《本草纲目》诸版中的地位与贡献 176
《本草纲目》江西本系统版本概说 181
万历末翻刻江西本及同版异扉本考察 196
《本草纲目》图版的讨论 198
《本草纲目》图版研究记事 202
法国新发现2 部《本草纲目》彩绘图谱考察 207
《本草纲目》引用医药书名核准之心得 212
《本草纲目》引用华佗出处存疑文献考证 218
《本草纲目》引文出处正误分析 223
简论《本草纲目》对中医药文献整理的贡献 227
《证类本草》中“唐本馀”的考证 230
《唐本草》以前的本草图 232
明《食物本草》作者及成书考 233
《本草纲目》所引《汤液大法》考 239
《三丰张真人神速万应方》考 244
《天宝单方药图》考略 250
青霞子及《宝藏论》考 254
第三卷 字词释证
关于《本草纲目》异体字取舍的研究 269
关于《本草纲目》金陵本缺笔讹字的考订 274
《本草綱目》金陵本缺筆訛字統計表 278
《本草纲目》释地八说 293
《本草纲目》若干地名的考订 305
《本草纲目》释病十策 311
《本草纲目》若干病名的考订 320
第四卷 药物及炮制辨析
葵类药物与动植物研究札记 331
钩吻药名辨析 339
李时珍论皂荚问题的探究 345
“青黏”考 348
从唐代底野迦到宋代人工牛黄 353
莂藤考 356
旋覆花汤中的“新绛”考 358
紫草茸名实功效考辨 360
对烟草传入及药用历史的考证 365
本草药物丛考 371
《本草纲目》部分药物性味及毒性讨论 418
车前子三种炮制法与所宜剂型的比较研究 425
菟丝子酒制法探讨 430
《本草纲目》阿胶三等分类法探讨 435
《本草纲目》矿物药炮制的文献出处情况探讨 439
第五卷 足迹花絮
疑义相与析——中德学者探讨《本草纲目》问答录 447
《本草纲目》研读启示录——从田野到书案，从书案到田野 502
正仓院“厚朴” 560
Discovery剧组关于《本草纲目》与李时珍采访前的备忘文稿 565
若干药物趣谈 584
研读《本草纲目》的几点感悟 591
附 苏图研究
《苏图研究》序 599
自序 601
总论 603
各论 605
衍论——唐图遗踪搜寻 695